杜仲甲羟戊酸激酶(EuMK)基因鉴定及生物信息学分析

编号 zgly0000829868

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲甲羟戊酸激酶(EuMK)基因鉴定及生物信息学分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 乌云塔娜  王淋  叶生晶 

作者单位 中国林业科学研究院  国家林业局  中南林业科技大学资源与环境学院经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  中南林业科技大学资源与环境学院  国家林业局中南林业调查规划设计院 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2014(1)

页码 6-12

年份 2014 

分类号 S603.2 

关键词 杜仲  甲羟戊酸激酶  反式聚异戊二烯  生物信息学 

文摘内容 甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase, MK)是萜类化合物生物合成甲羟戊酸(mevalonate pathway, MVA)途径的限速酶之一。为了探明EuMK对杜仲胶生物合成的调控机制, 对EuMK所编码蛋白质氨基酸序列的理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构、结构保守域以及基因组内含子和外显子结构特征等进行了全面的生物信息学分析, 结果发现EuMK蛋白质序列均存在3个与甲羟戊酸底物结合及催化反应有关的保守结构域; EuMK的氨基酸组成中性的疏水性蛋白居多数, 属于稳定的疏水性蛋白; 无明显的跨膜结构, 均在膜外; 二级结构为混合型结构的蛋白质。EuMK均含有4个外显子, 3个内含子; EuMK基因家族启动子顺式作用元件潜在功能的预测分析发现, 含有大量基本顺式作用元件TATAbox, CAATbox, 还含有光(AE-box、CGT-motif.Box4、G-box)、生长素(ERE、ABRE、TCA-element)响应等多个顺式调控元件。