马铃薯SBP转录因子家族的全基因组鉴定及进化和表达分析

编号 zgly0001652445

文献类型 期刊论文

文献题名 马铃薯SBP转录因子家族的全基因组鉴定及进化和表达分析

作者 郭存  李晓旭  刘成  李奎  郭永峰 

作者单位 中国农业科学院烟草研究所烟草行业基因资源利用重点实验室  中国农业科学院研究生院  曲靖市烟草公司  陕西中烟工业有限责任公司 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年20期

年份 2018 

分类号 S532  Q943.2 

关键词 SBP转录因子家族  马铃薯  拟南芥  生物信息学 

文摘内容 SBP转录因子家族是植物特有的一类转录因子家族,主要参与植物生长、发育和多种生理生化过程的信号传导。马铃薯是一种重要的经济和粮食作物,但马铃薯SBP转录因子家族的分析尚未见报道。本研究利用生物信息学技术,对马铃薯基因组进行分析,在马铃薯中共鉴定出16个SBP转录因子,并对其系统进化关系、编码基因结构以及基因表达模式进行研究。系统进化分析表明,马铃薯和拟南芥SBP转录因子家族成员共31个成员,被分成7个亚家族(Subgroup);结构分析表明,同一亚家族内的成员的蛋白保守结构域的类别、组成以及编码基因的基因结构具有高度的相似性,但不同亚家族的成员差异较大;基因表达分析表明,编码SBP转录因子家族成员的基因表达模式具有明显的时空特异性,且成员对不同的激素处理有不同的响应模式。本研究为进一步研究马铃薯SBP转录因子的功能以及可能的调控机制研究提供了理论依据。