盐生草基因Unigene7547片段的克隆与分析

编号 zgly0001652463

文献类型 期刊论文

文献题名 盐生草基因Unigene7547片段的克隆与分析

作者 周振国  孟亚雄  宋展树  李葆春  马小乐  司二静  汪军成  王化俊 

作者单位 甘肃农业大学农学院甘肃省干旱生境作物学重点实验室甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室  甘肃农业大学生命科学技术学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年22期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S156.4 

关键词 盐生草  转录组  生物信息学  亲水性  亚细胞定位 

文摘内容 为了从分子生物学角度研讨盐生草耐盐机理,挖掘耐盐基因,本研究以盐生草(Halogeton glomeratus)为材料,根据盐生草转录组测序结果,利用RT-PCR与SMARTer RACE技术克隆耐盐基因Unigene7547的cDNA全长,并应用生物信息学方法对该基因相关功能进行预测分析。结果克隆到Unigene7547基因的cDNA全长,该基因全长1 306 bp,开放阅读框为1 218 bp,编码405个氨基酸,分子量为45.16 kD,通过生物信息学分析显示,Unigene7547基因编码蛋白属于亲水性蛋白,呈酸性,无信号肽及跨膜区,亚细胞定位于细胞核内。发现Unigene7547中含有Thr、Ser、Tyr等磷酸化位点,主要以Thr、Ser磷酸化位点为主,可能影响细胞生理活动修饰调控等方面。Unigene7547基因蛋白二级结构中随机卷曲为37.78%、延伸链为28.89%、α螺旋为23.46%、β-转角为9.88%。该研究结果为进一步解析盐生草耐盐机理与培育耐盐新品种具有重要意义。