无瓣海桑根响应盐胁迫的转录组分析

编号 zgly0001747294

文献类型 期刊论文

文献题名 无瓣海桑根响应盐胁迫的转录组分析

作者 梁锐涛  韩维栋  杨少瑕  陈蓓蓓 

作者单位 广东海洋大学滨海农业学院 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2023,36(1)

页码 68-78

年份 2023 

分类号 S728.5 

关键词 无瓣海桑  盐胁迫  转录组  差异表达基因 

文摘内容 [目的]初步探究无瓣海桑的耐盐分子机制,筛选出无瓣海桑抗盐候选基因,为后续功能验证实验及林木抗盐性遗传育种奠定分子基础。[方法]以1年生无瓣海桑幼苗为材料,用500 mmol·L^(-1)NaCl分别处理0 d(对照组)和10 d(处理组),取不同条件下的根部组织进行转录组测序,并结合三代全长转录组数据进行后续生物信息学分析。[结果](1)与对照组相比,NaCl处理10 d后,无瓣海桑幼苗根系中共有14 401个差异表达基因,其中,7 153个上调,7 248个下调。(2)GO分析发现,共有11 068个差异基因在47个GO条目得到注释。(3)在KEGG富集分析中,共有6 189个差异基因富集到134条通路,其中,共有14条通路显著富集(P值《0.01,Q值《0.05)。(4)通过进一步对差异基因进行功能注释分析,共筛选出抗盐候选基因89个,其中,抗氧化基因24个,渗透调节物质基因22个,植物激素基因19个,蛋白激酶基因10个,转录因子基因14个。[结论]活性氧清除、渗透调节、植物激素、蛋白激酶及转录因子相关基因参与调控无瓣海桑盐逆境适应过程。