结球甘蓝自花和异花授粉诱导的柱头转录组分析

编号 zgly0001571898

文献类型 期刊论文

文献题名 结球甘蓝自花和异花授粉诱导的柱头转录组分析

作者 蒲敏  廉小平  罗绍兰  张贺翠  王玉奎  白晓璟  曾静  高启国  任雪松  朱利泉 

作者单位 西南大学农学与生物科技学院  重庆市蔬菜重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年01期

年份 2018 

分类号 S635.1 

关键词 结球甘蓝  自交不亲和性  转录组  差异表达基因 

文摘内容 分别以自花授粉30 min、异花授粉30 min和未授粉处理的甘蓝柱头进行Illumina HiSeq2000高通量转录组测序,分析自交不亲和性甘蓝自花授粉、异花授粉柱头与未授粉柱头中基因表达的差异。转录组测序共获得1.6×108对原始序列读取片段,总碱基数为2.38×1010 bp,与未授粉对照相比,自花、异花授粉后差异表达的基因分别有2 900个和2 328个,共有的差异表达基因1 904个。在差异表达基因背景和全部基因背景下,自花授粉较大比例的差异基因是细胞杀伤、胞外基质部分和核酸结合转录因子活性;异花授粉较大比例的差异基因是信号传递、胞外区域部分、结构分子活性和营养库活性。GO功能的显著性富集分析表明,自花授粉处理后特有的40个极显著的富集条目主要涉及糖跨膜转运活性、微管结合和钙调素依赖性蛋白激酶活性等。异花授粉特有的53个极显著的富集条目主要涉及法尼酸O–甲基转移酶的活性、微管负向运动和生长素跨膜运输等。自花授粉处理后特异差异表达的996个基因主要涉及钙离子结合、细胞骨架相关、茉莉酸和水杨酸代谢等生物过程,异花授粉处理后特异差异表达的424个基因主要涉及物质跨膜转运及脂质代谢。