耧斗菜WRKY转录因子家族生物信息学分析及抗盐基因筛选

编号 zgly0001750063

文献类型 期刊论文

文献题名 耧斗菜WRKY转录因子家族生物信息学分析及抗盐基因筛选

作者 陈丽飞  杨丰瑞  白云  孟缘  于海航  李江  周蕴薇 

作者单位 吉林农业大学  定西市水土保持科学研究所 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2023,51(4)

页码 93-99

年份 2023 

分类号 S682.19 

关键词 耧斗菜  WRKY转录因子  生物信息学  盐胁迫 

文摘内容 为挖掘耧斗菜属植物WRKY的抗盐基因奠定理论基础,通过转录组数据分析,鉴定WRKY转录因子,并对家族成员进行生物信息学分析。结合表达模式对其功能进行分析,结果表明:从欧耧斗菜中鉴定出35个WRKY转录因子,根据WRKY七肽的数量和锌指结构特点可分为3亚族,每组成员分别有8、24、3个;其编码蛋白质氨基酸数为173~797个,分子量为19902.13~87973.25,均为亲水性蛋白,其中有1个稳定蛋白;亚细胞定位结果均在细胞核中。结合系统进化树,从14个差异显著表达的AvWRKY基因中,筛选出与已知抗盐的WRKY基因亲缘关系近的4个基因(AvWRKY3、AvWRKY7、AvWRKY16、AvWRKY34),作为在耧斗菜响应盐胁迫中发挥重要作用的候选基因。