杜仲脂氧合酶基因家族全基因组鉴定及其表达特性研究

编号 zgly0001691258

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲脂氧合酶基因家族全基因组鉴定及其表达特性研究

作者 朱利利  庆军  杜庆鑫  何凤  杜红岩 

作者单位 中国林业科学研究院经济林研究开发中心  国家林业局杜仲工程技术研究中心 

母体文献 植物研究 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 Q943.2  S567.19 

关键词 杜仲  LOX基因家族  生物信息学  基因功能 

文摘内容 LOX(脂氧合酶)是动、植物中普遍存在的一种氧合酶,在植物的生长发育和逆境胁迫中发挥重要作用。本研究在杜仲基因组范围内,利用生物信息学方法对LOX基因家族进行全面鉴定,并分析了其基因结构、定位及其所编码蛋白质的理化性质、结构特征、分类和功能等。结果显示:杜仲LOX基因家族有23条LOX基因序列,分别定位于细胞质或叶绿体中,分为9-LOX和13-LOX两个亚家族,其中9-LOX类型仅包含一个,13-LOX类型包含22个; 23个LOX基因非平均分布于12条scaffolds上,一些基因发生串联分布; RNA-Seq表达结果显示6个13-LOX类型基因在杜仲叶、果、树皮和种仁中几乎没有表达,而其他17个LOX基因表达具有组织和时空表达特异性。研究结果为揭示杜仲LOX基因家族成员的功能提供重要线索,为进一步研究LOX基因家族提供理论基础。