应用重测序技术对杜仲叶片变异及皱缩性状基因的筛选

编号 zgly0001743037

文献类型 期刊论文

文献题名 应用重测序技术对杜仲叶片变异及皱缩性状基因的筛选

作者 陈梦娇  李慧  王珊珊  杜红岩  王璐  朱景乐 

作者单位 河南农业大学  东北林业大学  中国林业科学研究院经济林研究所 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2022,50(6)

页码 7-14

年份 2022 

分类号 S722.5  S792.99 

关键词 杜仲  芽变杜仲  叶片性状变异  叶片变异基因 

文摘内容 以观赏型良种‘华仲11号’杜仲(Eucommia ulmoides‘Huazhong No.11’)及其叶片呈皱缩性状的芽变杜仲为研究对象,提取DNA进行10倍的全基因组重测序。对比‘华仲11号’杜仲及其芽变杜仲在叶片形态形成、激素合成方面的变异位点,分析相关变异位点的生物学意义,筛选叶片皱缩形状相关的基因,探索与杜仲(Eucommia ulmoides)叶片皱缩性状紧密联系的单核苷酸多态性(SNP)位点,筛选杜仲叶片性状相关变异基因。结果表明:‘华仲11号’杜仲及其芽变杜仲,与参考基因组之间均发生单核苷酸多态性、小片段的插入和缺失(InDel)、染色体结构变异(SV)。在杜仲参考基因组(1.18×10^(9))基础上,芽变杜仲具有5732071个单核苷酸多态性、293566个小片段的插入和缺失、3722个染色体结构变异;‘华仲11号’具有5711141个单核苷酸多态性、293078个小片段的插入和缺失、3870个染色体结构变异。通过‘华仲11号’杜仲及其芽变杜仲之间的比较发现,含有变异位点的26722条基因与蛋白功能变异有关;根据数据库功能注释结果,共筛选出13条有关基因及30个单核苷酸多态性位点。