杜仲MVA途径相关基因全长cDNA序列特征研究

编号 zgly0000832034

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲MVA途径相关基因全长cDNA序列特征研究

学科分类 220.45;经济林学

作者 王淋  乌云塔娜  刘慧敏  叶生晶  杜红岩 

作者单位 中南林业科技大学资源与环境学院经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  中南林业科技大学资源与环境学院  中国林业科学研究院 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2014(1)

页码 94-102

年份 2014 

分类号 S727.34 

关键词 杜仲  萜类物质  MVA途径  序列分析  生物信息学 

文摘内容 杜仲幼果和成熟果转录组测序的基础上,分离鉴定了幼果和成熟果MVA途径ACOT、HMGS、HMGR基因全长cDNA序列,并对基因的核苷酸序列及其相应氨基酸序列的组成成分、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构、分子系统进化等进行分析。EuACOT基因全长cDNA为1 248 bp,编码416个氨基酸,属于稳定疏水性蛋白,无明显的跨膜区,在进化上分属于不同的分类群,与烟草和番茄的ACOT蛋白间的亲缘关系最为接近;EuHMGS基因全长cDNA为1 356 bp,编码452个氨基酸,属于不稳定的疏水性蛋白,无明显的跨膜区,在进化上分属于不同的分类群,与茶树的HMGS蛋白间的亲缘关系最为接近;EuHMGR基因全长cDNA为1 770 bp,编码590个氨基酸,属于不稳定的疏水性蛋白,有两个较明显的跨膜区,在进化上分属于不同的分类群,与杜仲的HMGR蛋白间的亲缘关系最为接近;以上三个蛋白的二级结构均是以α-螺旋和螺环结构为主的混合型结构。