杜仲EuHMGRS基因家族的鉴定及生物信息学分析

编号 zgly0000815644

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲EuHMGRS基因家族的鉴定及生物信息学分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 王淋  乌云塔娜  叶生晶 

作者单位 中南林业科技大学资源与环境学院经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  中南林业科技大学资源与环境学院  中国林业科学研究院  国家林业局  国家林业局中南林业调查规划设计院 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2013(4)

页码 16-24

年份 2013 

分类号 S603.2 

关键词 杜仲  萜类物质  基因家族  3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A 

文摘内容 萜类物质合成关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGRS)是甲羟戊酸途径(mevalonatephway, MVA)的第1个限速酶, 对萜类物质的合成具有重要的作用。为了探明EuHMGRS家族基因对杜仲萜类物质合成的调控机制, 对EuHMGRS家族基因进行生物信息学分析, 结果表明: 杜仲EuHMGRS基因中存在HMGRS特有的保守的活性位点, 其中包括2个HMG—CoA结合位点(EMPVGYVQIP、TTEGCLVA)和2个NADP(H)结合位点(DAMGMNM、GTVGGGT), 因此可以确定为杜仲HMGRS基因家族, 在杜仲中该家族成员至少包含3个基因, 记为EuHMGRl2、EuHMGRl8、EuHMGRl9。杜仲HMGRS与其它植物的HMGRS蛋白相比在中间区域和C端保守性高, 在N端的序列相似性较低, 预示不同的HMGRS基因功能上具有高度的保守性, 但是对于在亚细胞定位可能会具有多样性。