杜仲EuACOTS基因家族的鉴定及生物信息学分析

编号 zgly0000815642

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲EuACOTS基因家族的鉴定及生物信息学分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 乌云塔娜  王淋  叶生晶 

作者单位 中国林业科学研究院  国家林业局  中南林业科技大学资源与环境学院经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  中南林业科技大学资源与环境学院  国家林业局中南林业调查规划设计院 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2013(4)

页码 1-8

年份 2013 

分类号 S603.2 

关键词 杜仲  乙酰CoA  酰基转移酶  生物信息学 

文摘内容 乙酰CoA酰基转移酶(acetylCoACacetyltransferase, ACOT)是萜类化合物生物合成甲羟戊酸(mevalonatepathway, MVA)途径的起始酶, 为了揭示生物合成杜仲胶的机制, 对杜仲ACOTS基因家族进行全面的生物信息学分析。EuACOTS家族含有3个基因, 分别记为EuAC07＇8、EuACOT9、EuACOTl0。对其氨基酸序列的理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性以及同源进化等性质进行了分析, 结果发现EuACOTS蛋白质的性质结构均较为相似, 均存在2个硫解酶的特异保守序列, 均属于稳定的疏水蛋白, 无明显的跨膜区。在对EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件潜在功能的预测分析中发现, EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件进行比较发现启动子作用既有保守性, 又有特异性, 其中EuACOTS家族含有大量基本顺式作用元件TATAbox, CAATbox以及光(AE—box、BoxI、MNFl)、乙烯(ERE)、真菌诱导(Box—W1)和脱落酸(ABRE)等多个顺式调控元件。