枣抑制消减cDNA文库构建与分析

编号 zgly0001531431

文献类型 期刊论文

文献题名 枣抑制消减cDNA文库构建与分析

作者 魏琦琦  段经华  冯延芝  李芳东  张琳 

作者单位 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室  中南林业科技大学经济林培育与利用湖南省2011协同创新中心  中国林业科学研究院经济林研究开发中心 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S665.1 

关键词 枣  抑制消减杂交  cDNA文库  生物信息学分析  功能注释 

文摘内容 枣树具有独特的开花结果特性,为获得枣花发育基因,以金丝4号枣不同发育时期的花蕾和同时期的叶片cDNA互为试验方和驱动方,利用抑制消减杂交技术分别构建了枣花和枣叶抑制消减杂交cDNA文库(SSH文库)。枣花和枣叶SSH文库重组率分别是92.05%和90.26%,插入片段长度均介于200~2 000 bp之间,主要集中于1 000 bp左右。分别从枣花和枣叶SSH文库中随机挑选1 000个阳性克隆进行DNA测序、组装拼接,结果显示枣花SSH文库中获得96条unigene,其中contigs 43个,singletons 53个,96条unigene预测得到73个ORF,经过同源比对分析获得有注释的序列20条,按功能分为7类;枣叶SSH文库中获得86条unigene,其中contigs 45个,singletons 41个,86条unigene预测得到70个ORF,经过同源比对分析获得有23条注释的序列,按功能分为6类。