铝胁迫下柱花草SSH文库构建及表达序列标签分析

编号 zgly0001392016

文献类型 期刊论文

文献题名 铝胁迫下柱花草SSH文库构建及表达序列标签分析

作者 王奇峰  易琼  李昆志  陈丽梅  玉永雄 

作者单位 昆明理工大学生命科学与技术学院生物工程技术研究中心  西南大学动物科技学院 

母体文献 植物学报 

年卷期 2010年06期

年份 2010 

分类号 S54  Q943.2 

关键词 铝胁迫  cDNA文库  表达序列标签  柱花草  抑制消减杂交 

文摘内容 柱花草栽培种热研2号(Stylosanthes guianensis‘Reyan2’)对铝毒有较强的耐受性。为了鉴定其在铝胁迫下的诱导基因,利用抑制消减杂交(SSH)技术构建在300μmol·L-1铝胁迫下正向cDNA文库。挑选插入片段大于300bp的600个克隆进行测序,共获得504条表达序列标签(EST)。序列重复性分析表明,其中12.1%的EST只有1次重复,61.4%的EST有2-16次重复,重复出现次数较高的EST是细胞色素P450(53次,占10.5%)、病原诱导型胰蛋白酶抑制剂(44次,占8.7%)和衰老相关蛋白(37次,占7.3%)。BLASTX分析显示,504条EST中有97种非冗余基因,其中包括46条功能已知基因和51条功能未知序列。46条功能已知EST中有30个为已报道铝胁迫相关基因,16个是新发现的铝胁迫相关基因。SSHcDNA文库提供的信息为阐明柱花草耐铝毒的分子机制提供了重要线索。