细叶百合DREB转录因子生物信息学及胁迫应答表达分析

编号 zgly0001747590

文献类型 期刊论文

文献题名 细叶百合DREB转录因子生物信息学及胁迫应答表达分析

作者 谭萌萌  孙绍营  王静文  王依萍  燕浩  张彦妮 

作者单位 东北林业大学园林学院 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2023,38(1)

页码 95-101

年份 2023 

分类号 S644.1 

关键词 细叶百合  生物信息学分析  DREB转录因子  胁迫表达 

文摘内容 DREB转录因子是AP2/ERF家族的主要成员,在植物应对非生物胁迫中发挥重要作用。目前还没有针对细叶百合DREB转录因子家族的系统分析。本研究基于细叶百合(根、茎、叶)转录组数据筛选出12个DREB转录因子,命名为LpDREB1-LpDREB12,并对其进行生物信息学及不同组织在胁迫下的表达模式分析。结果表明,细叶百合DREB蛋白多为不稳定蛋白且具有一定亲水性,α螺旋和无规则卷曲是蛋白二级结构的主要组成部分。系统进化分析显示,12个细叶百合DREB转录因子同61个拟南芥DREB转录因子聚类到一起,说明细叶百合和拟南芥DREB家族成员具有较高的保守性。表达模式分析表明,在干旱、盐、低温及脱落酸胁迫下12个细叶百合DREB基因的表达均有组织特异性。研究结果丰富了细叶百合DREB基因数据库,为挑选优质抗逆基因提供了理论依据。