DRE顺式作用元件dsDNA芯片制备

编号 zgly0001372971

文献类型 期刊论文

文献题名 DRE顺式作用元件dsDNA芯片制备

作者 张玉宝  郭志鸿  李同祥  王亚军  谢忠奎 

作者单位 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所皋兰生态与农业综合试验站  兰州大学生命科学学院 

母体文献 武汉植物学研究 

年卷期 2009年02期

年份 2009 

分类号 Q78 

关键词 DRE顺式作用元件  DREB转录因子  双链DNA芯片 

文摘内容 DRE顺式作用元件能与DREB转录因子特异结合,在诱导逆境(干旱、高盐、低温)基因表达过程中起重要作用。dsDNA(double strand DNA)微阵列芯片技术能够有效地检测序列特异性DNA结合蛋白质(转录因子)与大量DNA靶点(顺式作用元件)的特异性结合,可有效分析生物分子结合作用。根据DRE顺式作用元件核心序列设计并化学合成含发夹结构的单链DNA探针,采用TaqDNA聚合酶在片延伸,并对其在片延伸体系的反应温度、Mg2+浓度以及单链探针是否变性等条件进行了优化。结果表明,50℃的反应温度,2.5mmol/L的Mg2+浓度和单链不变性是TaqDNA聚合酶在片延伸的最佳条件。优化方法制备的dsDNA芯片将更有利于DRE顺式作用元件与DREB抗逆转录因子相互作用的研究。