紫薇LiUFGT基因的克隆与生物信息学分析

编号 zgly0001747532

文献类型 期刊论文

文献题名 紫薇LiUFGT基因的克隆与生物信息学分析

作者 李春霞  乔中全  邓涪元  陆柳淑  李雪露  何钢 

作者单位 中南林业科技大学生命科学与技术学院  湖南省林业科学院林草培育研究所 

母体文献 湖南林业科技 

年卷期 2023,50(1)

页码 24-30

年份 2023 

分类号 S961.6 

关键词 紫薇  LiUFGT基因  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 为探究类黄酮葡萄糖基转移酶基因(UFGT)在紫薇花青素生物合成中的分子机制及表达情况,本文以紫薇花瓣为试材,根据紫薇转录组序列设计特异性引物,通过PCR克隆LiUFGT基因开放序列,进行生物信息学分析,再对LiUFGT基因进行荧光定量PCR分析。结果表明:LiUFGT基因的开放阅读框长1 431 bp,编码476个氨基酸,相对分子量为52 465.22 Da,理论等电点为5.66;LiUFGT蛋白为不稳定疏水蛋白,且以α-螺旋和无规则卷曲为主;经过多序列比对发现,LiUFGT蛋白和石榴的相似性最高,为68.70%;系统进化分析表明,LiUFGT蛋白与杨树、石榴、夏栎UFGT蛋白的同源性最高。此外,LiUFGT基因在红色花瓣紫薇中的表达量最高,在白色中最低,说明LiUFGT基因对紫薇花色基因具有直接调控的作用。本研究结果为进一步阐明LiUFGT基因在紫薇花青素合成机制中的调控作用提供了理论基础。