角毛壳菌降解粗纤维基因的筛选

编号 zgly0000510596

文献类型 期刊论文

文献题名 角毛壳菌降解粗纤维基因的筛选

作者 张海燕  杨谦 

作者单位 哈尔滨工业大学生命科学与工程系 

母体文献 林产化学与工业 

年卷期 2007,27(3)

页码 21-26

年份 2007 

分类号 TQ352 

关键词 角毛壳菌菌丝体  cDNA文库  表达序列标签  生物信息学分析  降解粗纤维基因 

文摘内容 以角毛壳菌菌丝体为材料，构建cDNA文库并进行了部分表达序列标签(ESTs)的分析。文库的滴度为1．02×10^6pfu／mL，重组率为95．3％，插入片段平均长度大于1．2kb。在cDNA文库中随机选择克隆从5’端测序得到1219个高质量ESTs，拼接为804条独立基因。其中460条(57．2％)与NCBI中非冗余蛋白质库(NR)已知基因有不同程度同源性的代表已知功能基因，344(42．8％)条独立基因与NR库中基因没有显著同源性的代表未知功能新基因。从已知基因中鉴定出了降解粗纤维的基因：β-1，4-内切葡聚糖酶基因、β-葡萄糖苷酶基因、β-内切木聚糖酶基因、木糖苷酶基因、漆酶基因。