美洲黑杨雄性花芽cDNA克隆测序及表达序列标签(ESTs)特性分析

编号 zgly0000481702

文献类型 期刊论文

文献题名 美洲黑杨雄性花芽cDNA克隆测序及表达序列标签(ESTs)特性分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 周祥明  张冰玉  苏晓华  王大海  黄秦军  张香华  张志毅 

作者单位 北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点开放实验室  中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2006,42(11)

页码 37-41

年份 2006 

分类号 S718.46  Q943.2 

关键词 美洲黑杨  雄性花芽  cDNA文库  表达序列标签 

文摘内容 采用SMART技术构建美洲黑杨雄性花芽cDNA文库。随机挑选4200个克隆进行序列测定, 获得原始序列3092个ESTs, 去除插入片段短于150bp的序列和污染序列后, 获得有效ESTs序列3087个, 平均长度515bp。对聚类后的416个Clusters分别进行单独拼接, 得到相应的Contigs和Singletons分别为451和1104个, 并通过与NCBI等核酸数据库进行比对、查询和注释, 获得已知功能和未知功能的基因1015个, 无序列相似性的新基因540个。这些数据为进一步研究高等植物花发育提供了一个极有价值的资源。