中国樱桃InDel标记开发及其在蔷薇科果树中通用性评价

编号 zgly0001693199

文献类型 期刊论文

文献题名 中国樱桃InDel标记开发及其在蔷薇科果树中通用性评价

作者 王珏  王燕  张静  陈涛  王磊  陈清  汤浩茹  王小蓉 

作者单位 四川农业大学园艺学院  四川农业大学果蔬研究所  四川农业大学生命科学学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S662.5 

关键词 中国樱桃  全基因组  InDel标记  蔷薇科果树  通用性 

文摘内容 对栽培和野生中国樱桃进行De novo基因组测序和比对,在全基因组范围内检测筛选出50 617个InDel位点,并挑选均匀分布的200个标记进行验证,其中,27个标记在中国樱桃种内表现出多态性。利用多态性标记,对不同来源的192份中国樱桃(168份栽培和24份野生)种质进行基因型分型,共检测到60个等位基因(Na),平均每个标记2.2个;基因多样性指数(Hs)为0.010～0.500,平均0.239;多态性信息含量(PIC)为0.010～0.375,平均0.198,表明中国樱桃遗传基础相对狭窄。根据聚类结果和地理分布将192份中国樱桃种质大致划分为5个群体。筛选出在蔷薇科李亚科樱属、李属、桃属、杏属、苹果亚科梨属、苹果属和蔷薇亚科草莓属、悬钩子属等重要果树共8个属156个个体中表现出较好通用性标记34个。物种与中国樱桃亲缘关系越近,InDel标记的多态性越高。