中国美利奴羊(新疆型)羊毛长度与产毛量的全基因组关联分析

编号 zgly0001742538

文献类型 期刊论文

文献题名 中国美利奴羊(新疆型)羊毛长度与产毛量的全基因组关联分析

作者 徐新明  哈妮克孜·吐拉甫  刘剑锋  石刚  付雪峰  于丽娟  拉扎特·艾尼瓦尔  狄江 

作者单位 新疆畜牧科学院  中国农业大学动物科技学院 

母体文献 西北农林科技大学学报:自然科学版 

年卷期 2022,50(8)

页码 1-7

年份 2022 

分类号 S826.912 

关键词 中国美利奴羊(新疆型)  全基因组  羊毛性状  产毛量  羊毛长度 

文摘内容 【目的】对中国美利奴羊(新疆型)羊毛长度和产毛量性状进行全基因组关联分析(GWAS),挖掘影响这2个性状的遗传标记,揭示这些性状产生的遗传机制。【方法】以366只中国美利奴羊(新疆型)为对象,对其周岁羊(16月龄)和成年羊(30月龄)个体的羊毛长度和产毛量(污毛质量)性状进行描述性统计。提取试验羊DNA,采用Illumina OvineSNP50 BeadChip中密度芯片(包括54241个SNP位点),对周岁羊和成年羊的羊毛长度和产毛量进行GWAS。基于single-locus回归方法、permutation方法、Ovisaries Annotation Release 100和绵羊数量性状位点数据库(Sheep QTLdb)进行统计分析、基因注释和SNP验证。【结果】试验羊群体羊毛性状的平均值均在正常范围内,最大值和最小值均符合正态分析要求,可进行GWAS。从试验羊群体中共筛选出44798个SNP,每条染色体上的SNP数量为672~5150个,SNP间的距离为49.97~65.59 kb。挖掘出21个与羊毛性状相关的SNP,其中s65179.1、OAR25_10510703.1、OAR3_112640501.1和s56106.14个SNP分别位于KIF16B、RYR2、ANAPC1和DPP6基因内,并且这4个SNP位置均位于基因的编码区;其他SNP注释在FIBIN、HSD17B11、PIAS1基因附近。QTL分析结果表明,OAR25_10510703.1定位到2个与纤维长度相关的QTL和1个与污毛质量相关的QTL,OAR7_15117952.1定位到1个与纤维长度相关的QTL和1个与初级纤维直径变异系数相关的QTL,可见这2个位点对中国美利奴羊(新疆型)羊毛长度和产毛量具有显著性作用。【结论】在周岁和成年中国美利奴羊(新疆型)鉴定出了21个与羊毛长度与产毛量显著相关的SNP,揭示了中国美利奴羊纤维长度和产毛量性状的遗传结构。