甘薯G病毒吉林分离物的全基因组序列测定与分析

编号 zgly0001704076

文献类型 期刊论文

文献题名 甘薯G病毒吉林分离物的全基因组序列测定与分析

作者 马俊丰  李小宇  张春雨  周雪平  王永志 

作者单位 吉林农业大学  吉林省农业科学院  中国农业科学院植物保护研究所 

母体文献 植物保护 

年卷期 2020年03期

年份 2020 

分类号 S432.41 

关键词 甘薯G病毒(SPVG)  全基因组  比对分析  系统发育 

文摘内容 利用RT-PCR结合RACE方法,从感染SPVG的甘薯叶片中获得甘薯G病毒吉林分离物Jilin-gzl的全基因组序列。测序获得的Jilin-gzl分离物(GenBank No.Mk392509)基因组为10 797 nt。该病毒基因组含有一个10 464 nt的开放阅读框,编码由3 488个氨基酸构成的多聚蛋白。在P1和P3基因中也发现了由移码翻译产生的PISPO蛋白和PIPO蛋白。比对分析显示,在开放阅读框水平上Jilin-gzl与6个不同分离物核苷酸序列一致性为79%～99%,氨基酸一致性为92%～99%,其中与SC11、IS103、HG167和Jesus_Maria分离物一致性最高,与WT325和AI一致性最低。系统发育分析显示,Jilin-gzl与HG167和WCFR11系统发育关系最近,与中国台湾地区分离物WT325系统发育关系较远。这是中国大陆地区关于SPVG分离物全基因序列的首次报道,同时也是首次在中国东北地区发现SPVG。该研究探明了Jilin-gzl分离物的基因结构,系统发育关系,丰富了SPVG基因组序列信息,为后续开展SPVG种群的遗传进化及功能研究奠定了基础。