贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析

编号 zgly0001693873

文献类型 期刊论文

文献题名 贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析

作者 兰青阔  赵新  陈锐  王成  陈笑芸  汪小福  王永  兰璞 

作者单位 天津市农业质量标准与检测技术研究所  浙江省农业科学院农产品质量标准研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S567.231 

关键词 贝母属  叶绿体基因组  SNP位点  生物信息学分析  检测方法 

文摘内容 贝母属植物是中国中药材的宝库,由于形态上难以区分,在民间应用、临床应用和中药市场中还存在混淆应用、以次充好的现象,急需开发基于新型分子标记位点的精准检测方法。本研究应用多重序列比对、SNP筛选等生物信息学分析手段,对贝母属15种植物28条叶绿体基因组序列进行分析。结果发现,贝母属叶绿体基因组DNA同源性达97.22%,通过分析共发现SNP位点5 879个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,川贝母鉴别候选位点4个,瓦布贝母鉴别候选位点37个,太白贝母鉴别候选位点147个,浙贝母鉴别候选位点91个,湖北贝母鉴别候选位点271个,平贝母鉴别候选位点1 393个,伊贝母鉴别候选位点89个。本研究还对SNP位点在精准鉴定、精确定量应用方面进行了讨论,可为川贝母中药资源鉴定提供技术支撑。