柳叶芹叶绿体基因组组装与序列特征

编号 zgly0001741439

文献类型 期刊论文

文献题名 柳叶芹叶绿体基因组组装与序列特征

作者 闫嵩  柳驰  任伟超  刘秀波  徐姣  马伟 

作者单位 黑龙江中医药大学药学院  黑龙江中医药大学  开姆尼茨工业大学  黑龙江中医药大学药学院、中药制药过程新技术国家重点实验室(江苏康缘药业股份有限公司) 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2022,50(2)

页码 49-52

年份 2022 

分类号 Q949.763.3  Q943.2 

关键词 柳叶芹  叶绿体基因组  系统发育  伞形科 

文摘内容 以2020年5月31日采自黑龙江省伊春市的柳叶芹(Czernaevia laevigata turcz.)为试验材料,利用十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)提取基因组DNA,采用Illumina NovaSeq平台进行高通量测序,得到柳叶芹完整的叶绿体基因组序列,分析柳叶芹叶绿体基因组组装、序列特征、系统发育。结果表明:柳叶芹叶绿体基因组总长度146161 bp,包括1个大单拷贝区长度为93538 bp、1个小单拷贝区长度为17779 bp,由2个反向重复序列分别分隔,每个反向重复序列为17422 bp。对柳叶芹叶绿体全基因组共鉴定出133个基因。系统发育分析表明,柳叶芹与疏叶当归有密切的亲缘关系。柳叶芹的叶绿体基因组序列,为研究伞形科其他植物提供了较为详细、完善的资料,为该物种鉴定以及群体和个体水平的遗传差异分析提供了新的方法。