杨柳科植物叶绿体基因组结构及变异分析

编号 zgly0001696968

文献类型 期刊论文

文献题名 杨柳科植物叶绿体基因组结构及变异分析

作者 路东晔  张磊  张国盛  郝蕾 

作者单位 内蒙古农业大学林学院  中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2020年02期

年份 2020 

分类号 Q943.2 

关键词 杨柳科  叶绿体基因组  基因组结构变异  系统发育 

文摘内容 【目的】获取杨柳科叶绿体基因组的结构及序列特征,揭示杨柳科植物的系统发育关系。【方法】利用Excel和本地Blast,分析统计杨柳科已公布的23种植物叶绿体基因组大小、结构组成、基因数量、排列顺序及内含子等信息;同时基于55个共有单拷贝蛋白编码基因,采用NJ法进行系统发育分析。【结果】杨柳科23种植物叶绿体基因组大小在155～159 kb,主要由大单拷贝区(LSC)长度差异引起。各物种基因排列顺序基本一致,均为2个IRs和2个SCs的典型四元组合结构,4个边界主要位于rpl22、ycf1、rps19基因处。psbZ、ycf15、lhbA、infA、trnK、trnG、trnL、trnV、trnI、trnA等基因存在缺失现象,引起基因数量差异。内含子在细胞色素复合物(petB)基因、RNA聚合酶(rpoC2)基因和核糖体蛋白(rpl2)基因等内发生结构变异,引起基因长度差异。系统进化分析结果表明,杨树聚类为4个高支持率进化支,钻天柳等7种柳树分为2个进化支。【结论】叶绿体基因组支持杨属、柳属独立进化,为杨柳科系统分类和系统发育提供了分子证据。