苹果LysM类受体激酶基因家族鉴定与表达分析

编号 zgly0001540234

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果LysM类受体激酶基因家族鉴定与表达分析

作者 左存武  张卫娜  毛娟  姜雪峰  马宗桓  苏静  陈佰鸿 

作者单位 甘肃农业大学园艺学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  LysM–类受体激酶  生物信息学分析  表达 

文摘内容 以LysM(PF01476)和Pkinase(PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在全基因组范围比对分析了苹果(Malus×domestica Borkh.)LysM-RLK家族的成员,对其家族成员的理化性质、进化关系、染色体分布、基因结构等进行了分析;基于已公布的转录组学数据,分析了LysM-RLK基因在苹果组织、发育过程和生物胁迫中的表达情况。通过分析,共获得12个苹果LysM-RLK基因,其氨基酸序列大小介于553~1 053,分子量介于62.65~119.04 kD,等电点介于5.11~7.45,主要位于质膜;根据进化分析将其分为3个亚组,亚组内各成员的外显子—内含子结构呈现较为相似的特征。基因表达数据显示,苹果的4个LysM-RLK基因表达存在较大的组织特异性,7个基因在苹果腐烂病和再植病发病过程中为差异表达。