水稻Cu/Zn-SOD基因的克隆、表达及生物信息学分析

编号 zgly0001634545

文献类型 期刊论文

文献题名 水稻Cu/Zn-SOD基因的克隆、表达及生物信息学分析

作者 骆鹰  谢旻  张超  王伟平  朱建华  汪启明  饶力群 

作者单位 湖南农业大学生物科学技术学院  湖南科技学院化学与生物工程学院  湖南杂交水稻研究中心杂交水稻国家重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年10期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S511 

关键词 水稻  铜锌超氧化物岐化酶基因  克隆  表达  生物信息学分析 

文摘内容 为了探究水稻铜锌超氧化物岐化酶基因(OsCu/Zn-SOD)的功能,以水稻品种日本晴(Oryza sativa japonica)为材料,采用同源克隆法获得OsCu/Zn-SOD,并对其进行表达及生物信息学分析。结果表明,OsCu/Zn-SOD基因cDNA序列为606 bp,编码152个氨基酸,CDS区459 bp,碱基组成A为22.7%、T为24.4%、G为29.4%、C为23.5%。OsCu/Zn-SOD蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水;二级结构中以无规则卷曲和延伸链结构为主,三级结构同源建模成功,主要是螺旋和转角;亚细胞定位OsCu/Zn-SOD主要分布在细胞质中,推测可能在翻译、运输结合和能量代谢过程中发挥重要作用,无跨膜结构域,无信号肽;该蛋白序列中存在8个丝氨酸磷酸化,4个苏氨酸磷酸化位点。进化分析表明,克隆的OsCu/Zn-SOD氨基酸序列与玉米、短柄草的同源关系较近,具有较高的保守性,与小立碗藓的同源关系较远。RT-PCR分析表明,OsCu/Zn-SOD基因在各组织中均有表达,水稻孕穗期中茎的表达最高,其次分别为叶和穗,根中表达量最低。本研究为进一步研究OsCu/Zn-SOD在水稻抗逆中的作用提供了重要的帮助。