偃松PpSS和PpSE基因克隆及序列分析

编号 zgly0001750552

文献类型 期刊论文

文献题名 偃松PpSS和PpSE基因克隆及序列分析

作者 王思瑶  于宏影  刘洋  李翊宁  周鑫  南方 

作者单位 国家林业和草原局哈尔滨林业机械研究所  中国林业科学研究院寒温带林业研究中心 

母体文献 温带林业研究 

年卷期 2023,6(1)

页码 35-40

年份 2023 

分类号 S791.24 

关键词 偃松  SS  SE  克隆 

文摘内容 【目的】克隆偃松甾醇代谢途径关键基因SS和SE,为促进偃松甾醇高效合成奠定基础,为药用偃松遗传改良提供重要基因资源。【方法】利用偃松RNA-Seq数据筛选偃松SS和SE基因并克隆,通过生物信息网站及软件对其进行序列分析。【结果】从偃松中克隆2个甾醇代谢途径关键基因SS和SE,分别属于SS和SE基因家族,命名为PpSS和PpSE。二者均具有完整的开放读码框(ORF),分别长1230bp和1647bp,编码409和548个氨基酸。PpSS编码的氨基酸序列与马尾松SS家族蛋白(GenBankID:AHI96421.11)相似度最高,为95.11%,PpSE编码的氨基酸序列与银杏SE家族蛋白(GenBankID:AVG44184.1)相似度最高,为80.98%。PpSS蛋白存一个异戊二烯合成酶C1超家族位点,PpSE蛋白存在一个鲨烯单加氧酶超家族位点。【结论】PpSS和PpSE分别为偃松SS和SE基因家族中的新基因,两个基因的获得为进一步挖掘其在偃松甾醇代谢中的调控机制研究奠定了基础。