苹果CR4基因家族鉴定与表达分析

编号 zgly0001651722

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果CR4基因家族鉴定与表达分析

作者 吕前前  刘钰玺  李静轩  马宗桓  姜雪峰  王宝林  毛娟  褚明宇  陈佰鸿  左存武 

作者单位 甘肃农业大学园艺学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年10期

年份 2018 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  CR4  生物信息学分析  低温  腐烂病  表达 

文摘内容 以RCC1(PF00415)、TNFR_c6(PF00020)和Pkinase(PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在苹果全基因组范围比对分析了CRINKLY4(CR4)家族成员,对其理化性质、进化关系、染色体分布等进行了分析;基于qPCR分析了CR4基因在苹果腐烂病发生和低温胁迫过程中的表达情况。通过分析,共获得8个苹果CR4基因,其氨基酸序列大小介于668～1 690,分子量介于71.73～187.61 kD,等电点介于5.69～8.66,主要位于质膜;根据进化分析将其分为两个亚组。PCR表达分析结果表明,CR4基因在苹果不同组织和品种间存在不同的表达模式。分别有8个和6个CR4基因在苹果花芽感受低温和接种腐烂病菌后至少在1个时间点发生差异表达。其中,MD03G1068800在花芽感受低温后上调达25倍以上,而MD00G1166500和MD01G1153100在腐烂病发生后上调达150倍以上,以上3个CR4基因可作为后续功能研究的候选基因。