慈竹C3H基因克隆及其生物信息学分析

编号 zgly0001435176

文献类型 期刊论文

文献题名 慈竹C3H基因克隆及其生物信息学分析

作者 周美娟  胡尚连  曹颖  卢学琴  任鹏  吴晓宇  李晓瑞 

作者单位 西南科技大学生命科学与工程学院 

母体文献 植物研究 

年卷期 2012年01期

年份 2012 

分类号 S795 

关键词 慈竹  C3H基因  克隆  生物信息学分析 

文摘内容 香豆酸-3-羟化酶(C3H)是调控植物木质素生物合成的关键酶,本文以慈竹为材料,利用RT-PCR技术克隆慈竹C3H基因,并对其进行生物信息学分析,为通过基因工程手段降低工业用竹木质素含量奠定基础。结果表明,该cDNA序列全长为1 581 bp,编码区为1 539 bp,编码512个氨基酸,蛋白分子量为58.33KD,等电点为9.09;氨基酸序列和结构分析显示C3H有一个保守区域,即P450结构域。系统进化分析表明,该基因与毛竹和水稻的C3H基因具有很高的同源性。慈竹与毛竹和水稻C3H基因编码蛋白为亲水性蛋白,这三种编码蛋白很可能定位在内质网(膜)上,其编码蛋白的二级结构及三级结构都含有丰富的α-螺旋和无规卷曲,β-转角和延伸链的含量较少,都含有2个相对保守的无序化区域。该基因已在GenBank上注册,基因序列登录号为JF693629,可能与慈竹木质素的生物合成有关。