慈竹4CL基因的克隆及其生物信息学分析

编号 zgly0001354263

文献类型 期刊论文

文献题名 慈竹4CL基因的克隆及其生物信息学分析

作者 胡尚连  曹颖  黄胜雄  孙霞  卢学琴  蒋瑶 

作者单位 西南科技大学生命科学与工程学院 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2009年08期

年份 2009 

分类号 S795.504 

关键词 慈竹  4CL基因  克隆  生物信息学分析 

文摘内容 【目的】克隆慈竹木质素生物合成酶4CL基因,研究其序列特征,为今后利用该基因调控慈竹木质素的生物合成研究奠定基础。【方法】参照其他物种4CL基因保守区,设计简并引物,以慈竹幼笋cDNA为模板,克隆到1条750 bp的4CL基因保守区片段。以这条保守区片段为模板,结合5′RACE和3′RACE克隆4CL基因全长序列,并对其进行了生物信息学分析。【结果】成功克隆了慈竹4CL基因全序列,该序列CDS区全长为1 674 bp,编码558个氨基酸;氨基酸序列中存在两大4CL氨基酸保守域(SSGTTGMPKGV和GEICIRG),其中前一个氨基酸保守域的第7个氨基酸位点变为M,与常见的L不同,表明慈竹的4CL基因发生了一定变异。系统进化分析表明,该基因(Na4CL)与水稻的Os4CL4和黑麦草的Lp4CL2具有很高的同源性。【结论】克隆了慈竹木质素合成酶4CL基因全长序列,在GenBank上注册为EU327341,可能与慈竹木质素生物合成有关。