编号
zgly0000701824
文献类型
期刊论文
文献题名
基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析
学科分类
220.1520;林木遗传学
作者单位
中国科学院海洋研究所
中国科学院研究生院
母体文献
海洋通报
年卷期
2010(1)
页码
59-64
年份
2010
分类号
Q954
关键词
皱纹盘鲍
EST
串联重复序列
SSR
文摘内容
皱纹盘鲍大规模EST的分析研究较少, 为了研究其基因组转录本的基本特征并为皱纹盘鲍中开发EST-SSR功能性标记奠定基础, 我们利用生物信息学手段对NCBI公共数据库中的5784条皱纹盘鲍EST序列进行EST-SSR特征分析。分析结果表明: (11皱纹盘鲍EST中串联重复序列类型丰富; (2)皱纹盘鲍EST Gene Ontology注释序列SSR类型单一; (3)皱纹盘鲍EST-SSR分布广泛富, 是EST-SSR标记开发的优良资源。