基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析

编号 zgly0000701824

文献类型 期刊论文

文献题名 基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 袁泽轶  张琳琳  张国范 

作者单位 中国科学院海洋研究所  中国科学院研究生院 

母体文献 海洋通报 

年卷期 2010(1)

页码 59-64

年份 2010 

分类号 Q954 

关键词 皱纹盘鲍  EST  串联重复序列  SSR 

文摘内容 皱纹盘鲍大规模EST的分析研究较少, 为了研究其基因组转录本的基本特征并为皱纹盘鲍中开发EST-SSR功能性标记奠定基础, 我们利用生物信息学手段对NCBI公共数据库中的5784条皱纹盘鲍EST序列进行EST-SSR特征分析。分析结果表明: (11皱纹盘鲍EST中串联重复序列类型丰富; (2)皱纹盘鲍EST Gene Ontology注释序列SSR类型单一; (3)皱纹盘鲍EST-SSR分布广泛富, 是EST-SSR标记开发的优良资源。