亚麻EST-SSR信息分析与标记开发

编号 zgly0001392359

文献类型 期刊论文

文献题名 亚麻EST-SSR信息分析与标记开发

作者 龙松华  李翔  邓欣  王玉富  王进  何东锋  陈信波 

作者单位 中国农业科学院麻类研究所  湖南农业大学作物基因工程湖南省重点实验室 

母体文献 武汉植物学研究 

年卷期 2010年05期

年份 2010 

分类号 S563.2 

关键词 亚麻  分子标记  EST  SSR 

文摘内容 与基因组SSR相比,以EST为基础的EST-SSR分子标记具有自身的优点。本研究从11240条亚麻(Linum sitatissmum L.)EST序列中检索出877条含有SSR的序列,其出现频率为7.8%。其中以三核苷酸重复出现的频率最高,占总SSR序列的60.1%;其次是二核苷酸重复,占21.9%;四、五和六核苷酸重复占18%。根据这些含SSR的EST序列共设计了73对SSR引物,在8份亚麻材料间通过PCR扩增检测,有63对引物扩增出清晰条带,引物可用率86.3%;有17对引物在8份亚麻材料间显现出多态性,占可扩增引物的26.3%。