‘库尔勒香梨’脱萼组与宿萼组样品差异表达基因的筛选

编号 zgly0001491973

文献类型 期刊论文

文献题名 ‘库尔勒香梨’脱萼组与宿萼组样品差异表达基因的筛选

作者 孙晓霞  牛建新  王博慧  裴茂松  李陈静  曹福军 

作者单位 石河子大学农学院园艺系  特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室 

母体文献 果树学报 

年卷期 2015年06期

年份 2015 

分类号 S661.2 

关键词 ‘库尔勒香梨’  萼片  转录组测序  差异表达分析  基因功能注释 

文摘内容 【目的】系统研究‘库尔勒香梨’脱萼组和宿萼组花器官的转录组表达情况,筛选2者之间的差异表达基因,为进一步阐明‘库尔勒香梨’萼片脱落与宿存分子机理奠定基础。【方法】采用Illumina高通量测序技术对‘库尔勒香梨’脱萼组和宿萼组代表样品进行测序,利用生物信息学方法筛选2者的差异表达基因和进行功能基因预测。【结果】Trinity法拼接后得到48 894条unigenes序列,从中选取了2组样品中共表达和单独表达的SPL转录因子进行了功能探究,发现3条unigenes可能与萼片发育有关。筛选的差异表达基因获得了Gene Ontology和KEGG数据库的注释,涉及植物激素信号转导、光合代谢、苯丙氨酸代谢、芳香族化合物合成、细胞发育等与萼片发育相关过程。【结论】筛出了2组样品的差异表达基因,获得了与萼片发育相关的基因及其对应的功能注释,为今后进一步研究‘库尔勒香梨’萼片脱落与宿存分子机理奠定了良好基础。