昆虫RNA-Seq数据的分析流程

编号 zgly0001447834

文献类型 期刊论文

文献题名 昆虫RNA-Seq数据的分析流程

作者 刘金定  张赞  黄水清  李飞 

作者单位 南京农业大学植物保护学院  南京农业大学信息科学技术学院 

母体文献 应用昆虫学报 

年卷期 2013年05期

年份 2013 

分类号 Q963 

关键词 高通量RNA测序  段序列比对  转录组拼接  基因功能注释  基因表达定量  基因差异表达 

文摘内容 随着高通量RNA测序(RNA-Seq)技术的发展和测序成本迅速下降,RNA-Seq技术已经成为生物学研究的重要工具,为生物学家全面地了解和研究转录组提供了机遇。高通量测序具有读长短、存在一定比例的测序错误、数据量大等特点,因此RNA-Seq数据分析与基因组分析和传统的EST数据分析有所不同。本文通过介绍不同的测序平台、原始数据产生和低质量数据过滤的计算流程,对短序列比对、转录组拼接、功能注释、以及差异表达分析进行了研究和分析,最后对RNA-Seq在昆虫学研究中的应用进行了综述,并对RNA-Seq技术进行了总结和展望。