基于转录组测序的云南紫叶子花苞片颜色相关基因表达模式研究

编号 zgly0001747074

文献类型 期刊论文

文献题名 基于转录组测序的云南紫叶子花苞片颜色相关基因表达模式研究

作者 孙利娜  吴林巧  杨舒婷  龚建英  林茂  李冰  王华新 

作者单位 广西壮族自治区林业科学研究院  广西壮族自治区林业勘测设计院 

母体文献 广西林业科学 

年卷期 2023,52(1)

页码 1-13

年份 2023 

分类号 S685.99 

关键词 分子育种  转录组测序  叶子花  基因表达 

文摘内容 为给叶子花苞片颜色形成的分子机理研究提供参考,以云南紫叶子花(Bougainvillea spectabilis’Senjakala’)为研究对象,采用转录组测序技术对其始花期、转色期、盛花期和末花期的苞片进行测序,并进行荧光定量PCR验证,通过KEGG富集分析苞片颜色的代谢途径,比较每两个时期间的差异基因及表达模式,探究其苞片不同时期的代谢途径及相关基因表达模式。结果表明,甜菜碱代谢途径、类黄酮代谢途径、苯丙烷代谢途径和类胡萝卜素代谢途径参与云南紫叶子花苞片发育过程,共有145个与苞片颜色相关的单基因簇参与53种酶的合成,并对应53个相应的基因。DOD基因在甜菜碱代谢途径中大量表达,是甜菜碱代谢途径的关键基因;类黄酮代谢途径中,基因CHS、CCoAOMT、SAM-MSPI1、TC4H、CYP98A2、F3H和KCS11起正向调控作用,F3’H起负向调控作用,FLS、CHI和NAR既有正向又有负向调控作用;苯丙烷代谢途径中,基因POD、β-GC、COMT、PAL和CAD1均表达显著,是该途径的主要调节基因;基因CCD4、ZEP和AAO是类胡萝卜素代谢途径的关键基因。这些基因在苞片整个发育过程中既有上调又有下调表达,并呈现一定规律,即与苞片颜色合成代谢或抗逆相关的基因在苞片颜色合成期主要呈上调表达,与分解代谢相关的基因主要呈下调表达。荧光定量PCR验证结果与转录组结果一致,本次转录组数据可靠。