5-氮杂胞苷对苦瓜果实成熟及转录表达谱的影响

编号 zgly0001747308

文献类型 期刊论文

文献题名 5-氮杂胞苷对苦瓜果实成熟及转录表达谱的影响

作者 郭金菊  吴廷全  王茹芳  谭德龙  曹海顺  王瑞  张长远 

作者单位 广东省农业科学院设施农业研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报:自然科学版 

年卷期 2023,51(2)

页码 93-101

年份 2023 

分类号 S642.501 

关键词 苦瓜  5-氮杂胞苷  转录组测序  果实成熟 

文摘内容 【目的】研究5-氮杂胞苷(5-azaC)对苦瓜果实成熟和基因表达模式的影响,为解析苦瓜果实成熟的分子调控机制提供理论依据。【方法】以苦瓜(Momordica charantia L.)高世代自交系E12201-e1为材料,利用50 mmol/L 5-azaC处理绿熟期(授粉后18 d)苦瓜果实,以ddH2O处理为对照,观察处理组(TR)和对照组(CK)果实的表型变化,并利用RNA-seq技术比较TR和CK苦瓜果肉组织中的转录水平差异。【结果】50 mmol/L 5-azaC处理能明显延迟苦瓜果实成熟。RNA-seq获得的数据质量较高,可满足后续分析需求。通过筛选共获得1773个差异表达基因(DEGs),其中1007个上调基因,766个下调基因。GO和KEGG分析结果表明,DEGs主要富集在细胞组分和分子功能模块,217个DEGs共富集到93条代谢通路中,其中30个DEGs显著富集到光合作用和苯丙烷类生物合成通路。8个DEGs参与细胞壁代谢过程,其中6个基因在5-azaC处理中下调表达。共获得681个差异表达转录因子(TFs),分属于220个TF家族。12个DEGs的qRT-PCR结果与RNA-seq结果变化趋势一致。【结论】5-azaC处理抑制苦瓜果实成熟,并影响果实成熟相关基因的表达模式。