谷子MYB转录因子响应Sclerospora graminicola侵染的生物信息学及表达分析

编号 zgly0001644883

文献类型 期刊论文

文献题名 谷子MYB转录因子响应Sclerospora graminicola侵染的生物信息学及表达分析

作者 韩彦卿  王鹤  刘锐  武彩娟  王慧娜  张宝俊  韩渊怀 

作者单位 山西农业大学农学院  山西农业大学农业生物工程研究所  山西农业大学新农村发展研究院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年15期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S435.15 

关键词 谷子  白发病菌  MYB转录因子  转录组测序  表达模式 

文摘内容 谷子白发病可严重降低谷子的产量和品质,谷子MYB转录因子在调控生物胁迫响应中扮演重要的角色。本研究依据课题组前期白发病菌侵染谷子不同时期的相关转录组数据,获得6个显著差异表达的MYB转录因子,结合ExPASY、GSDS、Phytozome、ProtComp 9.0和MEGA7.0等软件对其启动子元件、亚细胞定位及系统进化等分析。随后,利用qRT-PCR方法对该6个转录因子的表达模式进行验证。结果表明,通过比较分析6个显著差异表达的MYB转录家族与玉米、水稻、拟南芥MYB家族共同构建的进化树,发现谷子MYB基因家族与玉米、水稻等禾本科聚为一类,与拟南芥亲缘关系较远;亚细胞定位预测结果显示,4个MYB转录因子定位于细胞质中,其余2个主要定位于胞外。顺式作用元件分析,发现谷子6个MYB转录因子中均含有响应防御胁迫和真菌激发响应、MeJA、脱落酸和水杨酸等作用元件。最后,基于荧光定量PCR的差异表达数据进一步验证了MYB转录因子在抗病过程中发挥重要转录调控作用。该研究结果可为今后MYB基因的克隆、功能验证以及开展抗病分子育种提供理论依据。