谷子种子白发病菌带菌检测及种群多态性分析

编号 zgly0001674883

文献类型 期刊论文

文献题名 谷子种子白发病菌带菌检测及种群多态性分析

作者 宋振君  李志勇  王永芳  任世龙  白辉  董志平 

作者单位 河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室  河北师范大学生命科学学院 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2019年03期

年份 2019 

分类号 S435.15 

关键词 谷子  白发病菌  种子带菌  聚合酶链式反应  单倍型 

文摘内容 为检测不同地区谷子种子携带白发病菌Sclerospora graminicola的情况以及种群多态性,以我国谷子不同主产区收集的95份代表性谷子品种种子为材料,提取种子基因组DNA并作模板,利用白发病菌28S rRNA序列设计特异性引物进行PCR扩增,将所获得的PCR产物测序后与白发病菌28S rRNA序列进行比对。结果表明,特异性引物Sg-28S-403-F/Sg-28S-1221-R对白发病菌具有高度的特异性,扩增出819 bp的特异性目标片段,有效检测灵敏度为0.125 ng/μL。在95份谷子种子中,26份种子检测出特异性扩增条带,所有扩增条带对应序列与白发病菌28S rRNA序列的相似性达98%以上,并且带菌种子全部来自春谷区。分析26份阳性样品的28S rRNA序列,得到58个变异位点和34种单倍型,其中单倍型SG2出现频率最高,内蒙古、陕西、山西、河北和辽宁省区的白发病菌都具有该单倍型,表明不同地理来源的白发病菌28S rRNA序列存在差异,SG2为优势单倍型。