牦牛SMAD4基因SNPs检测及其与生长性状的关联分析

编号 zgly0001747444

文献类型 期刊论文

文献题名 牦牛SMAD4基因SNPs检测及其与生长性状的关联分析

作者 周建强  祁增源  韩银仓  刘秀  孙永刚 

作者单位 青海省畜牧兽医科学院  甘肃农业大学动物科学技术学院 

母体文献 西北农林科技大学学报:自然科学版 

年卷期 2023,51(3)

页码 1-8

年份 2023 

分类号 S823.85 

关键词 牦牛  SMAD4基因  单倍型  生长性状 

文摘内容 【目的】研究牦牛SMAD4基因SNPs与生长性状的关系,探寻与牦牛生长性状相关的分子标记。【方法】采用DNA测序和单倍型分型技术,对青海牦牛SMAD4基因进行SNPs检测及其基因分型、连锁不平衡和单倍型分析,并对多态位点的基因型及组合单倍型与牦牛生长性状的关联性进行分析。【结果】牦牛SMAD4基因在内含子区域存在6个突变位点,其中g.393A》G、g.555A》G、g.6525A》G和g.18360C》T均存在3种基因型,g.582A》T和g.6492C》T均存在2种基因型。连锁不平衡分析发现,6个位点间不存在强连锁不平衡效应。单倍型分析发现,在14种不同的单倍型中,单倍型H 1的发生频率最高。关联性分析表明,g.393A》G位点与体斜长、胸围和管围均显著相关(P《0.05),g.555A》G位点与体斜长显著相关(P《0.05),g.582A》T位点与体质量和体高均显著相关(P《0.05),g.6492C》T位点与体高显著相关(P《0.05),g.6525A》G位点与体质量显著相关(P《0.05),g.18360C》T位点与胸围显著相关(P《0.05)。基因型组合发现,单倍型H 1H 14可能是影响牦牛生长性状的最优组合。【结论】牦牛SMAD4基因内含子区域上的6个位点与生长性状显著关联,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因。