利用cDNA-AFLP技术研究苹果柱型与非柱型cDNA的差异表达

编号 zgly0000536805

文献类型 期刊论文

文献题名 利用cDNA-AFLP技术研究苹果柱型与非柱型cDNA的差异表达

作者 朱元娣  孙凌霞  李春雨  张文  王涛 

作者单位 中国农业大学农学与生物技术学院果树系  中国农业大学农业生物技术国家重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2007,34(2)

页码 283-288

年份 2007 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  柱型苹果  柱型基因  差异表达分析  cDNA-AFLP 

文摘内容 以苹果(Malus×domestica Borkh．)柱型品种舞姿、非柱型品种富士及其杂交F1群体中柱型、非柱型单株为研究试材，应用cDNA—AFLP(cDNA—amplified fragment length polymorphism)技术，研究柱型与非柱型苹果cDNA的差异表达，探讨了苹果柱型基因Co表达的分子机制。通过64对引物组合的cDNA-AFLP分析获得了1630条在柱型与非柱型苹果中差异表达的片段。经过BSA(bulked segregant analysis)分析和反向Northern杂交鉴定，获得了11个差异表达的cDNA片段，并进行了克隆、测序和序列同源性检索分析。有5个片段在GenBank数据库中发现同源序列，其余的6个功能未知。核酸和氨基酸比对分析中同源性最高的是片段A7和A16。A7的核苷酸序列同源于红叶石楠Photinia fraseri 26S核糖体RNA(97％)、蛋白同源于玉米的细胞色素P450单加氧酶(91％)，A16的核苷酸(85％)及蛋白(93％)同源于直果草属Triphysaria versicolor的α—expansin 2基因。对A7、A16两个候选基因片段再进行正向Northern杂交验证，在富士中表达最强，在非柱型后代、柱型后代及舞姿中表达依次减弱。由此推断，由细胞色素P450单加氧酶基因所调控的赤霉素GAs变化影响了苹果柱型性状的表达。