抽筒竹叶绿体基因组的密码子偏好性分析

编号 zgly0001686707

文献类型 期刊论文

文献题名 抽筒竹叶绿体基因组的密码子偏好性分析

作者 李江平  秦政  国春策  杨光耀  张文根 

作者单位 江西农业大学江西省竹子种质资源与利用重点实验室  江西省林业科学院 

母体文献 竹子学报 

年卷期 2019年02期

年份 2019 

分类号 Q943.2 

关键词 抽筒竹  密码子偏好性  叶绿体基因组  最优密码子 

文摘内容 以抽筒竹叶绿体全基因组序列为材料进行了密码子偏好性分析,结果表明:1)抽筒竹叶绿体基因组密码子偏性较弱,有效密码子数（Effective number of codon,ENC）在38. 85～61之间,平均值为49. 66; 2)密码子第1和第3位的GC含量一定程度上有相似性,GC1和GC2、GC3呈显著相关,而第2位GC含量和其它两位差异较大; 3)密码子偏爱以A或U结尾,RSCU值大于1. 00的密码子31个,其中16个第3位碱基为U、11个以A结尾、1个以G结尾; 4) GC12与GC3相关性较弱,回归系数为0. 357 63; 5)密码子偏好性更多受到选择的影响,代表基因多数落在标准曲线的下方。