酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性分析

编号 zgly0001684186

文献类型 期刊论文

文献题名 酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性分析

作者 胡晓艳  许艳秋  韩有志  杜淑辉 

作者单位 山西农业大学林学院 

母体文献 森林与环境学报 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 S665.1 

关键词 酸枣  叶绿体基因组  密码子  使用偏性 

文摘内容 通过分析枣属植物酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响其密码子使用偏性形成的主要因素。结果表明:酸枣叶绿体基因组有效密码子数(Nec)为47.72,密码子使用偏性较弱;中性绘图分析和使用的有效密码子数绘图分析(Nec-plot绘图分析)结果表明,酸枣叶绿体基因组密码子使用保守性较高,选择压力对密码子使用的影响较大;最优密码子分析确定UUU、GUA、UCA、ACA、AAU、AGA、GGG等7个密码子为最优密码子;奇偶偏差分析表明,密码子第3位碱基的使用存在偏好性,嘌呤的使用比嘧啶更频繁;基于同义密码子相对使用度的对应性分析表明,酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性的影响因素中GC含量影响最大,其他因素也有一定影响。酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性的影响因素中,来自外界的选择压力起主要作用,核苷酸组成和其他因素也发挥一定的作用。