杜仲Ref基因密码子偏好性分析

编号 zgly0001533951

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲Ref基因密码子偏好性分析

作者 刘慧敏  乌云塔娜  杜红岩 

作者单位 中国林业科学研究院经济林研究开发中心  国家林业局杜仲工程技术研究中心 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2016年03期

年份 2016 

分类号 S567.19 

关键词 杜仲  Ref基因  密码子  偏好性 

文摘内容 杜仲是世界上唯一的硬橡胶树种,是能够替代三叶橡胶的最具开发潜力的胶源植物。本研究以杜仲胶合成下游途径Ref基因为研究对象,运用Codon W和CUSPS等研究Ref基因的密码子组成特点及使用偏好性。研究结果表明,杜仲Ref基因的GC含量为49%,密码子第三位碱基的GC含量为59%;杜仲Ref基因有28个偏好使用的密码子,其中约60%(17个)的密码子以G/C结尾;与大肠杆菌、酵母、拟南芥和烟草的基因组密码子使用偏好性比较,杜仲与拟南芥基因组密码子的使用偏性更为接近,拟南芥更适合作为Ref转基因的受体。本研究为预测杜仲Ref基因的异源表达,适宜表达系统的选择以及Ref基因密码子的改造以提高其在宿主中的表达,进行有效的基因功能验证提供理论参考。