猕猴桃CHI密码子偏好性分析

编号 zgly0001512513

文献类型 期刊论文

文献题名 猕猴桃CHI密码子偏好性分析

作者 李崇高  冯新  高敏霞  钟春水  陈文光  刘萍元  陈义挺 

作者单位 福建省建宁县农业局  福建省农业科学院果树研究所  福建农林大学园艺学院 

母体文献 东南园艺 

年卷期 2016年05期

年份 2016 

分类号 S663.4 

关键词 猕猴桃  查尔酮异构酶  密码子  偏好性 

文摘内容 试验以GenBank登录的猕猴桃查尔酮异构酶基因CHI为基础,采用CodonW分析其偏好性,并分别与模式生物基因组进行比较。研究结果发现,猕猴桃CHI有效密码子数为55.93,密码子GG含量和第3位G/C含量分别为0.483和0.525,偏好性较强的密码子有29个,其中AAC、ACC、AGG、CCT和TCT具有极强的偏好性;此外,猕猴桃CHI与模式生物基因组均保持较大的偏好性差异。研究认为,猕猴桃CHI密码子整体偏好性较弱,但对部分特定密码子仍存在选择偏好。研究结果为猕猴桃CHI基因后续研究提供了科学依据。