红椿SRAP反应体系优化及引物筛选

编号 zgly0001535234

文献类型 期刊论文

文献题名 红椿SRAP反应体系优化及引物筛选

作者 李培  阙青敏  王芳  李俊成  朱芹  廖柏勇  陈晓阳 

作者单位 华南农业大学林学与风景园林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室  嘉应学院 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 S792.99 

关键词 红椿  SRAP分子标记  反应体系  引物筛选 

文摘内容 [目的]优化相关序列扩增多态性（SRAP）体系内的不同组分,建立适用于红椿SRAP分子标记的反应体系,并进一步从SRAP引物组合中筛选出稳定、多态性好的引物组合,为红椿遗传多样性研究奠定试验基础。[方法]针对SRAP-PCR反应体系中5个因素各设置8个水平,先利用单因素试验确定浓度梯度,后在确定的梯度范围内选定4个水平,按照正交试验L16（45）进行优化,结合正交直观分析法和新复极差法对各因素进行优化筛选。[结果]确定最优体系为总体系25μL,模板DNA 25 ng,上下游引物各0.3μmol·L-1,Taq DNA聚合酶1U,Mg2+2.5 mmol·L-1,d NTP 0.3 mmol·L-1。利用稳定的SRAP-PCR体系,从1 505对SRAP引物组合中筛选出30对优质引物组合。[结论]通过不同种源红椿基因组DNA的重复验证,获得了稳定清晰、多态性较强的扩增条带,表明所确定的最优体系稳定可靠,适用性较强,可用于不同种源红椿遗传多样性研究的后续实验。