红椿SSR-PCR体系建立和多态性引物筛选

编号 zgly0001501726

文献类型 期刊论文

文献题名 红椿SSR-PCR体系建立和多态性引物筛选

作者 湛欣  鲁好君  赵帅  陈晓阳  邓小梅 

作者单位 华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S792.99 

关键词 SSR  红椿  体系优化  引物筛选 

文摘内容 [目的]本研究旨在建立红椿SSR-PCR最佳反应体系,并筛选适于红椿SSR分析的高多态性引物。[方法]通过L16(45)正交试验设计,确立红椿SSR-PCR最佳反应体系;利用优化后的体系对来自楝科植物的135对SSR引物,在6个不同的红椿居群中进行扩增,筛出能有效扩增的引物并进一步筛选出适于红椿的高多态性引物。[结果](1)10μL基于荧光d UTP的SSR-PCR体系中包含:10×buffer 1.0μL,Taq酶(5 U·μL-1)0.1μL,Mg Cl2(25mmol·L-1)0.8μL,d NTP(200 mmol·L-1)0.025μL,荧光d UTP(1 nmol·μL-1)0.01μL,引物(10 mmol·L-1)0.8μL,DNA模板45 ng剩余用dd H2O补足;(2)筛选出29对能有效扩增的引物,复选后获得了12对适于红椿SSR分析的高多态性引物。[结论]建立了SSR-PCR最佳反应体系并筛选出高多态性引物,为红椿的分子标记等遗传学研究提供了基础。