海雀稗SRAP-PCR分子标记体系优化及引物筛选

编号 zgly0001516476

文献类型 期刊论文

文献题名 海雀稗SRAP-PCR分子标记体系优化及引物筛选

作者 刘燕  汪毅  马晶晶  史经昂  王志勇  刘建秀  郭海林 

作者单位 江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园)  南京农业大学园艺学院  海南大学农学院 

母体文献 草地学报 

年卷期 2016年05期

年份 2016 

分类号 S688.4 

关键词 海雀稗  SRAP标记  正交实验  体系优化  引物筛选 

文摘内容 以4个代表性海雀稗（Paspalum vaginatum）种质的叶片DNA为模板,采用L9（34）正交试验设计,对影响海雀稗SRAP-PCR反应的Mg2+、dNTP、引物和TaqDNA聚合酶的用量进行了优化,并比较了不同浓度模板DNA对扩增的影响,以确定适合海雀稗的SRAP-PCR最佳反应体系。结果表明:海雀稗SRAP-PCR最佳反应体系为10×PCR buffer 1μL、模板DNA50ng、Mg2+2.5mmol·L-1、dNTP150μmol·L-1、引物0.4μmol·L-1、TaqDNA聚合酶1.0U,总体积10μL。利用该反应体系从100对引物中筛选出可扩增清晰条带的引物83对,在83对引物中选出多态性丰富的引物44对。SRAP-PCR反应体系的优化及引物筛选,为今后利用SRAP标记技术进行海雀稗遗传多样性研究、基因定位、遗传图谱的构建以及分子标记辅助育种提供技术支持。