结缕草属植物SRAP-PCR体系的建立和优化

编号 zgly0001625937

文献类型 期刊论文

文献题名 结缕草属植物SRAP-PCR体系的建立和优化

作者 薛丹丹  郑轶琦  王志勇  郭海林  陈宣  刘建秀 

作者单位 南京农业大学园艺学院  江苏省中国科学院植物研究所 

母体文献 草业学报 

年卷期 2008年06期

年份 2008 

分类号 S688.4 

关键词 结缕草属植物  SRAP标记  单因子试验  正交设计  体系优化 

文摘内容 以SDS法提取的结缕草属植物叶片DNA为模板,分别采用单因子试验和正交设计试验2种方法,对影响结缕草属植物SRAP-PCR的Mg2+、dNTP、引物、Taq DNA聚合酶和模板DNA五个因素进行优化试验。单因子试验分别研究各因素在多水平条件下对SRAP-PCR反应体系的影响,得到最佳反应条件。正交设计采用L16(45)方案,综合考虑各因素间的相互作用,通过直观分析法获得各影响因素的最佳反应水平。根据4对引物对6份结缕草属植物材料扩增结果的验证比较,2种方法所获得的最佳反应体系存在一定的差异。通过综合比较和分析2种方法的优化体系扩增出的条带数、多态性条带数及多态性比率,最终建立了结缕草属植物SRAP-PCR的最佳反应体系:Mg2+2.00 mmol/L、dNTP 220μmol/L、引物0.20μmol/L、Taq DNA聚合酶0.50 U、模板DNA 60 ng、2μL 10×buffer,总体积为20μL。这一优化体系的建立为今后利用SRAP标记技术进行结缕草属植物遗传多样性、种质鉴定、遗传连锁图谱及亲缘关系分析等方面的研究提供了科学的依据。