基于SRAP标记的不同干形云南松遗传基础研究

编号 zgly0001724185

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SRAP标记的不同干形云南松遗传基础研究

作者 何承忠  吴治洋  沈德周  甘沛华  周安佩  纵丹 

作者单位 西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室  西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室  西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室 

母体文献 西南林业大学学报:自然科学 

年卷期 2021,41(2)

页码 1-10

年份 2021 

分类号 S791.257 

关键词 云南松  干形变异  遗传  基因  SRAP标记 

文摘内容 采用SRAP分子标记对6个居群不同干形云南松180份样品进行全基因组扫描,并对不同干形特有差异条带进行克隆及测序比对,预测调控干形变异的候选基因。结果显示:14对引物共扩增出584条带,多态带551条,多态带百分率为94.35%,平均每对引物扩增出41.7条带和39.4条多态带。6个居群云南松的有效等位基因数(Ne)为1.4516~1.4872,Nei's基因多样性指数(H)范围为0.2703~0.2904;2种干形云南松的有效等位基因数(Ne)介于1.3655~1.4541之间,Nei's基因多样性指数(H)变幅为0.2181~0.2687。居群间的遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)分别为0.1573和2.6787,干形间的遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)分别为0.0087和56.7002,表明居群间、不同干形云南松间的基因交流频繁,遗传分化较小。对26条不同干形云南松之间的特有差异条带序列分析表明,过氧化氢酶(kat A基因)、核酸内切酶、糖基水解酶和AN1锌指蛋白(SAP6)等可能参与了云南松干形发育的调控。