油桐ACPase基因克隆及生物信息学分析

编号 zgly0000870485

文献类型 期刊论文

文献题名 油桐ACPase基因克隆及生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘美兰  谭晓风  袁军  周俊琴 

作者单位 中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室 

母体文献 南方农业学报 

年卷期 2014(3)

页码 339-344

年份 2014 

关键词 油桐  酸性磷酸酶  ACPase  克隆  生物信息学 

文摘内容 【目的】克隆油桐酸性磷酸酶(ACPase)基因的全长序列,为进一步分析油桐ACPase的功能奠定基础。【方法】根据油桐转录组酸性磷酸酶蛋白全长序列设计引物,利用RT-PCR从油桐种子中克隆ACPase基因,对其cDNA序列、核苷酸序列的相似性、理化性质、疏水性、跨膜结构、二级结构及三级结构进行分析预测,同时进行多序列比对并构建系统树。【结果】克隆获得油桐ACPase基因,其开放阅读框为1152 bp,编码383个氨基酸残基,相对分子质量为40.94 kDa,理论pI为5.30,属可溶性不稳定蛋白。同源性和进化树的预测分析结果显示,油桐ACPase与毛果杨的ACPase蛋白同源性达84%。